Процесинг - це процесинг РНК (посттранскрипційна модифікації рнк)
Саме дана стадія відрізняє реалізацію наявної генетичної інформації у таких клітин, як еукаріоти і прокаріоти.
Інтерпретація даного поняття
У перекладі з англійської цей термін означає «обробка, переробка». Процесинг - це процес утворення зрілих молекул рибонуклеїнової кислоти з пре-РНК. Інакше кажучи, це сукупність реакцій, які призводять до трансформації первинних продуктів транскрипції (пре-РНК різних типів) у вже функціонуючі молекули.
Що стосується процесингу р- і тРНК, він найчастіше зводиться до відсікання з кінців молекул зайвих фрагментів. Якщо говорити про іРНК, то тут можна відзначити, що у еукаріот даний процес протікає багатоступінчасто.
Отже, після того, як ми вже дізналися, що процесинг - це перетворення первинного транскрипту в зрілу молекулу РНК, варто перейти до розгляду його особливостей.
Основні особливості даного поняття
Сюди можна віднести наступні:
- модифікацію як решт молекули, так і РНК, по ходу якої до них приєднуються специфічні послідовності нуклеотидів, що показують місце початку (кінця) трансляції;
- сплайсинг - відсікання неінформативних послідовностей рибонуклеїнової кислоти, які відповідають Інтрони ДНК.
Що стосується прокаріот, їх іРНК не схильна процесингу. Вона має здатність працювати відразу після закінчення синтезу.
Де протікає розглянутий процес?
У будь-якого організму процесинг РНК протікає в ядрі. Він здійснюється за допомогою особливих ферментів (їх групою) для кожного окремо взятого типу молекул. Також процесингу можуть бути схильні такі продукти трансляції, як поліпептиди, які безпосередньо лічені з іРНК. Даним змінам піддаються так звані молекули-попередники більшості білків - колагену, імуноглобулінів, травних ферментів, деяких гормонів, після чого починається реальне їхнє функціонування в організмі.
Ми вже дізналися, що процесинг - це процес утворення зрілих РНК з пре-РНК. Тепер варто заглибитися в природу самої рибонуклеїнової кислоти.
РНК: хімічна природа
Це рибонуклеїнова кислота, що представляє собою сополімер піримідинових та пуринових рібонуклеітідов, які з`єднані один з одним, точно так само, як і в ДНК, 3 `- 5`-фосфодіефірнимі містками.
Незважаючи на те що ці 2 види молекул схожі, вони відрізняються за кількома ознаками.
Відмінні ознаки РНК і ДНК
По-перше, у рибонуклеїнової кислоти присутній вуглецевий залишок, до якого примикають піримідинові і пуринові основи, фосфатні групи, - рибоза, у ДНК ж - 2`-дезоксирибоза.
По-друге, відрізняються і піримідинові компоненти. Подібними складовими виступають нуклеотиди аденіну, цитозину, гуаніну. У РНК замість тиміну присутній урацил.
По-третє, РНК має 1-цепочечную структуру, а ДНК - 2-цепочечная молекула. Але в ланцюзі рибонуклеїнової кислоти присутні ділянки з протилежного полярністю (комплементарної послідовністю), завдяки яким її одинична ланцюг здатна згортатися і утворювати «шпильки» - структури, наділені 2-спіральними характеристиками (як показано на малюнку вище).
По-четверте, з огляду на те, що РНК - одиночна ланцюг, який комплементарна лише перший з ланцюгів ДНК, гуанін не обов`язково повинен бути присутнім в ній в такому ж змісті, як і цитозин, а аденін - як урацил.
По-п`яте, РНК можна гідролізувати лугом до 2 `, 3`-циклічних діефіров мононуклеотидів. Роль проміжного продукту в гідролізі грає 2 `, 3`, 5-триефірів, нездатний до утворення в ході аналогічного процесу для ДНК зважаючи на відсутність у неї 2`-гідроксильних груп. У порівнянні з ДНК лужна лабільність рибонуклеїнової кислоти виступає корисним властивістю і для діагностичних цілей, і для аналітичних.
Відомості, що містяться в 1-цепочечной РНК, як правило, реалізуються в якості послідовності піримідинових та пуринових підстав, інакше кажучи, у вигляді первинної структури полімерного ланцюга.
Дана послідовність комплементарна генного ланцюжка (кодує), з якою відбувається «зчитування» РНК. Через даної властивості молекула рибонуклеїнової кислоти може специфічно зв`язуватися з кодує ланцюгом, однак не здатна цього робити з некодирующей ДНК-ланцюгом. Послідовність РНК, окрім заміни T на U, аналогічна тій, яка відноситься до некодирующей ланцюга гена.
Типи РНК
Практично всі вони залучені в такий процес, як біосинтез білка. Відомі такі типи РНК:
- Матричні (мРНК). Це молекули цитоплазматичної рибонуклеїнової кислоти, які виконують функції матриць синтезу білка.
- Рибосомная (рРНК). Це молекула цитоплазматичної РНК, що виконує роль таких структурних компонентів, як рибосоми (органел, що бере участь у білковому синтезі).
- Транспортні (тРНК). Це молекули транспортних рибонуклеїнових кислот, які беруть участь у перекладі (трансляції) інформації мРНК в послідовність амінокислот вже в білках.
Істотна частина РНК у вигляді першого транскриптів, які утворюються в еукаріотичних клітинах, у тому числі клітини ссавців, схильна в ядрі процесу деградації, і не грає в цитоплазмі інформаційної або структурної ролі.
У людських клітинах (культивованих) знайдений клас малих ядерних рибонуклеїнових кислот, безпосередньо не беруть участі у білковому синтезі, однак мають вплив на процесинг РНК, а також загальну клітинну «архітектуру». Їх розміри варіюють, вони містять 90 - 300 нуклеотидів.
Рибонуклеїнова кислота - основний генетичний матеріал у ряду вірусів рослин, тварин. Деякі віруси, що містять РНК, ніколи не проходять таку стадію, як зворотна транскрипція РНК в ДНК. Але все ж для багатьох вірусів тварин, наприклад для ретровірусів, характерний зворотний переклад їх РНК-геному, що направляється РНК-залежної зворотної транскриптазою (ДНК-полімеразою) з формуванням 2-спіральної ДНК-копії. У більшості випадків з`являється 2-спіральний ДНК-транскрипт впроваджується в геном, надалі забезпечуючи експресію вірусних генів і напрацювання новітніх копій РНК-геномів (також вірусних).
Посттранскрипційна модифікації рибонуклеїнової кислоти
Її молекули, синтезирующиеся з РНК-полімерази, завжди функціонально неактивні, виступають попередниками, а саме пре-РНК. Вони трансформуються у вже зрілі молекули лише після того, як пройдуть відповідні посттранскрипційна модифікації РНК - етапи її дозрівання.
Формування зрілих мРНК начитається в ході синтезу РНК і полімерази II на етапі елонгації. Вже до 5`-кінця поступовий зростаючої нитки РНК прикріплюється 5`-кінцем ГТФ, потім відщеплюється ортофосфат. Далі гуанін метіліруется з появою 7-метил-ГТФ. Таку особливу групу, що знаходиться у складі мРНК, іменують «кепом» (шапочкою або ковпачком).
Залежно від різновиду РНК (рибосомні, транспортні, матричні, пр.) Попередники піддаються різним послідовним модифікаціям. Приміром, попередники мРНК піддаються сплайсингу, метилированию, кепірованію, поліаденілювання, іноді й редагуванню.
Еукаріоти: загальна характеристика
Клітка еукаріот виступає доменом живих організмів, а в ній міститься ядро. Крім бактерій, архей, будь організми є ядерними. Рослини, гриби, тварини, включаючи групу організмів, іменовану протистами, - всі виступають еукариотическими організмами. Вони бувають як 1-клітинними, так і багатоклітинними, проте у всіх загальний план клітинної будови. Прийнято вважати, що ці настільки несхожі організми мають одне і те ж походження, через що група ядерних сприймається в якості монофілетичного таксону найвищого рангу.
На підставі поширених гіпотез, еукаріоти виникли 1,5 - 2 млрд. Років тому. Важлива роль в їх еволюції відводиться симбиогенеза - симбіозу еукаріотичної клітини, що мала ядро, здатної до фагоцитозу, і бактерій, проковтнутих їй, - попередників пластид і мітохондрій.
Прокаріоти: загальна характеристика
Це 1-клітинні живі організми, які не володіють ядром (оформленим), рештою мембранними органоїдами (внутрішніми). Єдиною великою кільцевої 2-цепочечной молекулою ДНК, містить основну частину генетичного клітинного матеріалу, є та, яка не утворює комплекс з білками-гистонами.
До прокаріотів відносять археї і бактерії, включаючи ціанобактерії. Нащадки без`ядерних клітин - органели еукаріот - пластиди, мітохондрії. Вони поділяються на 2 таксону в рамках рангу домену: Археї і Бактерії.
Дані клітини не мають ядерної оболонки, упаковка ДНК відбувається без залучення гістонів. Тип їх харчування осмотрофное, а генетичний матеріал представлений однією молекулою ДНК, яка замкнута в кільце, і є лише 1 реплікон. У прокаріотів залишаються органели, які мають мембранне будову.
Відмінність еукаріот від прокаріот
Основоположна особливість клітин еукаріот пов`язана з перебуванням у них генетичного апарату, який розташований в ядрі, де він захищений оболонкою. Їх ДНК лінійна, пов`язана з білками-гистонами, іншими білками хромосом, які відсутні у бактерій. Як правило, в їх життєвому циклі присутні 2 ядерні фази. Одна має гаплоїдний набір хромосом, а згодом зливаючись, 2 гаплоїдні клітини формують диплоїдну, яка містить вже другий набір хромосом. Буває й так, що при подальшому діленні клітина знову стає гаплоидной. Такого роду життєвий цикл, а також диплоїдний в цілому, не характерні для прокаріотів.
Найцікавішим відмінністю є наявність особливих органел в еукаріот, які мають власний генетичний апарат і розмножуються поділом. Ці структури оточені мембраною. Даними органеллами виступають пластиди і мітохондрії. За життєдіяльності та будовою вони дивно схожі з бактеріями. Дана обставина наштовхнула вчених на думку відносно того, що вони - нащадки бактеріальних організмів, які вступили в симбіоз з еукаріотами.
У прокаріотів є мала кількість органел, жодна з яких не оточена другий мембраною. У них відсутня ендоплазматичнийретикулум, апарат Гольджі, лізосоми.
Ще 1 важлива відмінність еукаріот від прокаріот - присутність явища ендоцитозу в еукаріот, включаючи фагоцитоз у більшості груп. Останнім називається здатність захоплювати допомогою укладення в мембранний міхур, а потім перетравлювати різні тверді частинки. Даний процес забезпечує найважливішу захисну функцію в організмі. Виникнення фагоцитозу, імовірно, пов`язано з тим, що їх клітини мають середні розміри. Прокаріотичні ж організми незрівнянно менше, через що в ході еволюції еукаріот виникла потреба, пов`язана з постачанням клітини значною кількістю їжі. У результаті серед них виникли перші рухливі хижаки.
Процесинг як один з етапів біосинтезу білка
Це другий етап, який починається після транскрипції. Процесинг білків протікає лише в еукаріот. Це дозрівання іРНК. Якщо бути точним, це видалення ділянок, які не кодують білок, і приєднання керуючих.
Висновок
У даній статті описано, що являє собою процесинг (біологія). Також розказано, що таке РНК, перераховані її типи і посттранскрипційна модифікації. Розглянуто відмітні особливості еукаріотів та прокаріотів.
Наостанок варто нагадати, що процесинг - це процес утворення зрілих РНК з пре-РНК.